Indonesia y Cuba tienen una buena relación en el ámbito económico. En 2023, ambos países realizaron transacciones comerciales por un total de 8,2 millones de dólares estadounidenses. Indonesia tuvo un superávit de 7 millones de dólares en esta transacción.
Los productos que Indonesia exporta a Cuba incluyen jabón, textiles, caucho, muebles y productos químicos. Por otro lado, las importaciones de Indonesia desde Cuba comprenden medicamentos, tabaco y cacao.
Además, la empresa operadora de hoteles de Indonesia, PT. Archipelago International, ha realizado una inversión en servicios al gestionar 6 hoteles en Cuba, entre ellos en Havana, Varadero, Holguin, Cayo Coco y las Brujas.